住民税（特別徴収）の納付が遅れたら：気づいた日にやることと、納期の特例

結論

気づいた日に、遅れた月の納入書（なければ予備の納入書に徴収月と納期限を書いたもの）で、従業員ごとの住所の市区町村へ今日納めます。延滞金は納期限の翌日から日数に応じてかかり、1か月を過ぎると割合が上がります。率と納め方は、納める先の市区町村の案内で確かめます。

まず、遅れたのはどの期限か

特別徴収義務者（会社）は、給与から住民税を差し引いた月の 翌月10日 までに、従業員それぞれの市区町村へ納めます（地方税法321条の5。西都市の根拠法令の一覧）。10日が土曜・日曜・祝日のときは翌営業日です（江東区）。

これからの納期限は次のとおりです（土日祝の繰り下げ込み）。

源泉所得税の期限（給与を払った月の翌月10日）と同じ日に並ぶことが多いですが、住民税は「給与から引いた月」、納める先は「従業員ごとの市区町村」 です。1人だけ別の市区町村に住んでいる従業員の分だけ漏れる、ということが起きます（推定）。

気づいた日にやる順番

1. どの市区町村の、どの月の分が遅れたかを一覧にする

遅れた分は、市区町村ごと・徴収した月ごとに分かれます。給与ソフトの帳票や、5〜6月に市区町村から届いた特別徴収税額の決定通知書（特別徴収義務者用）と照らし合わせて、次の表を作ります。

2. 遅れた月の納入書で納める（なければ予備の納入書）

• 納入書は月ごと：大阪市は「6月分から翌年5月分までの12枚と予備2枚の14枚綴り」を通知書に同封しています。遅れた月の納入書を使います
• 納入書が無い・書き損じた：大阪市は、予備の納入書（徴収月の記載がないもの）に、必ず「徴収月」と「納期限」を書いて使うよう案内しています。江東区のように、紛失などによる納入書の再発行をオンラインで申請できるところもあります
• 税額が途中で変わった：江東区は、税額を変えた納入書は送らないので、当初の納入書の金額を訂正して使うよう案内しています（大阪市は「納入金額（1）」を二重線で消して「納入金額（2）」に書く）
• 合わせない：遅れた月の分と今月の分は、納期限が違うので納入書を分けます（推定。納入書が月ごとに分かれているため）

期限を過ぎた納入書が使える場所 は、納入書と市区町村で違います。広島市は（市税の納付書全般の案内として）、「納期限」と書かれた納付書なら期限後でも金融機関で納められる、と案内しています。同じ案内では、「指定納期限」と書かれたものは、金融機関やコンビニでは納められず、市役所などの窓口に限られます。練馬区は、特別徴収の納付書を使える金融機関の地域を東京都・山梨県と関東各県に限っています。使えるか分からないときは、市区町村の納税の窓口に電話で聞き、窓口か、指定された方法で納めます。

eLTAX（地方税共通納税システム）で納めている会社は、インターネットで納めることもできます（江東区・京都市）。期限後に eLTAX で納めるときの延滞金の扱いは、納める先の市区町村に確かめます。

出典：大阪市 特別徴収税額の通知および納入について、江東区 特別徴収の納入について、広島市 納期限が過ぎている納付書で納付できますか、練馬区 納期が過ぎた場合の納付場所（いずれも 2026-10-01 確認）

3. 延滞金の通知を待って、別に納める

延滞金の納め方も、市区町村で違います。

• 練馬区：期限後の納付で延滞金が出た場合は、後日、差額延滞金納付書を送る ので、別に納める
• 広島市（市税の納付書の案内）：期限後に納めるときは延滞金がかかることがあるので、その場合は延滞金もあわせて納める
• 江戸川区：延滞金が 千円未満 のときは課されない

延滞金を自分で計算して上乗せせず、納める先の案内に従います。延滞金の割合は年ごとに変わります（江戸川区の表・京都市の説明）。率はリンク先で確かめてください。

4. 督促状が届いていたら、その日付を確かめる

督促状は、納期限後20日以内に送られます（東京都主税局）。届いていたら、督促状に書かれた期限と納め方で納めます。地方税法331条は、督促状を発した日から起算して 10日を経過した日 までに完納しないときは差押えをしなければならない、と定めています（西都市の根拠法令の一覧）。督促状は発した日から数えるので、届いた日ではなく督促状の日付を確かめ、届いたらすぐ納めます。埼玉県は、督促や催告でも納められないときは、事業所の預金や売掛金などを差し押さえると案内しています。

自分から先に納める場合と、督促状のあと

確かめた自治体の案内には、源泉所得税の不納付加算税のような「自分から先に納めれば軽くなる」決まりは書かれていませんでした。延滞金は、どちらでも 納期限の翌日から納めた日までの日数 に応じて計算されます（京都市・江戸川区）。

違いが出るのは、日数と、その先の手続きです。

埼玉県は、特別徴収の住民税を「事業主が従業員から預かった税金です」と書いています。地方税法324条3項には、徴収した住民税を納入しなかった特別徴収義務者への罰則の規定があります（埼玉県・西都市）。気づいた日に納めて、納めた日を市区町村に伝えておきます。

納期の特例を受けている会社

従業員が 常時10人未満 の会社は、市区町村に申請して承認を受けると、毎月の納期を年2回にできます（東京都主税局）。

出典：世田谷区（2026-10-01 確認）

担当者が見るところは4つです。

• 1回の遅れが、半年分になる：まとめて納めるので、遅れた分の額が大きくなります。延滞金も、まとめた額に対してかかります（推定）
• 承認の取消し：世田谷区・箕面市は、滞納があると承認を取り消すことがある（箕面市は「承認取消通知を送付」）と案内しています。取り消されると毎月の納付に戻り、再び申請できるのは、取消しから1年以上たってからです（世田谷区・箕面市の要件）
• 市区町村ごとの承認：住民税の納期の特例は、税務署の源泉所得税の納期の特例とは別に、区市町村に申請します（東京都主税局）。世田谷区の要件は「世田谷区において…滞納がない」ことなので、承認も取消しも、市区町村ごとに見ます。ある区では特例、別の市では毎月、ということがあります
• 承認の前の月は毎月：箕面市は「承認された月から適用」としています。承認の前の月に引いた分は、毎月の納期限のままです

次から遅れないための仕組み

• 納期限を「給与から引いた月」で入れる：上の表のように、土日祝を繰り下げた実日付を、市区町村の数だけでなく 月ごとに1つ カレンダーに入れます。源泉所得税と同じ日に並ぶ月が多いので、源泉所得税の納付期限が出るツール で出した日と並べて置くと漏れにくくなります
• 納める先の一覧を毎年6月に作り直す：特別徴収の税額は年度ごと（6月から翌年5月）に市区町村から通知されます（大阪市）。入社・退職・引っ越しで、納める先の市区町村は年度ごとに変わります（引っ越しの扱いは 従業員が引っ越したら）
• 給与ソフトで、納める先ごとの額を出す：マネーフォワード クラウド給与では、「帳票一覧」＞「住民税徴収額一覧表」で納付先ごとに徴収金額を確かめられ、「支払業務」画面で住民税の振込用の FB データを出せます。納付先の市区町村は「従業員情報」＞「一般情報」の「住民税」で直します（源泉所得税や住民税を納付する方法を教えてください。、住民税振込用のFBデータは出力できますか？、2026-10-01 確認）。市区町村からの通知の額は、eLTAX から出した特別徴収税額通知の CSV を取り込んで登録することもできます（住民税納付額を登録する方法を教えてください。）
• 1人で回している会社は、確かめる人を置く：給与の締めと納付を同じ人がやっていると、休んだ月に止まります。翌月10日の納付を、月次の締めの確認表に入れます（一人経理の月次の締め）

給与ソフトでそろえるかは、料金と機能の範囲を、申し込む前に公式で確かめてください。

窓口・専門家に聞くときの線

延滞金がかかるか、納期の特例が取り消されるかは、市区町村が判断します。そのまま送れる問い合わせの文面です。

（会社名）の（担当者名）です。特別徴収義務者の指定番号は（ ）です。（ ）年（ ）月に給与から徴収した住民税（従業員（ ）名分）の納入が、納期限（ ）を過ぎてしまいました。本日（ ）に納入しました（または、納入書が手元になく、再発行をお願いしたいです）。延滞金の納め方と、ほかに必要な手続きがあるかを教えてください。

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